Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MICAQ29983 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MICAQ29983 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MICAQ29983 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MICAQ29983 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MICAQ29983 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MICAQ29983 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MICAQ29983 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MICAQ29983 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MICAQ29983 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MICAQ29983 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MICAQ29983 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MICAQ29983 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MICAQ29983 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MICAQ29983 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MICAQ29983 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
MICAQ29983 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MICAQ29983 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MICAQ29983 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MICAQ29983 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
MICAQ29983 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MICAQ29983 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MICAQ29983 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MICAQ29983 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MICAQ29983 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MICAQ29983 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MICAQ29983 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MICAQ29983 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MICAQ29983 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MICAQ29983 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MICAQ29983 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MICAQ29983 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MICAQ29983 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MICAQ29983 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MICAQ29983 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MICAQ29983 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MICAQ29983 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MICAQ29983 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MICAQ29983 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MICAQ29983 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MICAQ29983 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MICAQ29983 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MICAQ29983 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MICAQ29983 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MICAQ29983 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MICAQ29983 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MICAQ29983 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MICAQ29983 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MICAQ29983 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MICAQ29983 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MICAQ29983 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MICAQ29983 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MICAQ29983 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MICAQ29983 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MICAQ29983 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MICAQ29983 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MICAQ29983 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MICAQ29983 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MICAQ29983 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MICAQ29983 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MICAQ29983 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MICAQ29983 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MICAQ29983 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MICAQ29983 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MICAQ29983 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MICAQ29983 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MICAQ29983 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MICAQ29983 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MICAQ29983 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MICAQ29983 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MICAQ29983 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MICAQ29983 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
MICAQ29983 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
MICAQ29983 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MICAQ29983 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MICAQ29983 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MICAQ29983 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MICAQ29983 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MICAQ29983 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MICAQ29983 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MICAQ29983 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MICAQ29983 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MICAQ29983 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MICAQ29983 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MICAQ29983 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MICAQ29983 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MICAQ29983 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MICAQ29983 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MICAQ29983 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MICAQ29983 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MICAQ29983 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MICAQ29983 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MICAQ29983 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MICAQ29983 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MICAQ29983 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MICAQ29983 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MICAQ29983 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MICAQ29983 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MICAQ29983 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MICAQ29983 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms