Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1D2Q14995 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1D2Q14995 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1D2Q14995 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NR1D2Q14995 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1D2Q14995 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1D2Q14995 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1D2Q14995 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1D2Q14995 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1D2Q14995 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1D2Q14995 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1D2Q14995 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NR1D2Q14995 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1D2Q14995 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1D2Q14995 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1D2Q14995 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1D2Q14995 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1D2Q14995 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1D2Q14995 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NR1D2Q14995 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1D2Q14995 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1D2Q14995 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1D2Q14995 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1D2Q14995 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1D2Q14995 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1D2Q14995 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1D2Q14995 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1D2Q14995 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1D2Q14995 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NR1D2Q14995 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NR1D2Q14995 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NR1D2Q14995 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
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