Protein–RNA interactions for Protein: Q13487

SNAPC2, snRNA-activating protein complex subunit 2, humanhuman

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC2Q13487 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNAPC2Q13487 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SNAPC2Q13487 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SNAPC2Q13487 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNAPC2Q13487 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNAPC2Q13487 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
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