Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RUNX1Q01196 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RUNX1Q01196 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RUNX1Q01196 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms