Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELF3P78545 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELF3P78545 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELF3P78545 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELF3P78545 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELF3P78545 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELF3P78545 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELF3P78545 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELF3P78545 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ELF3P78545 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELF3P78545 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELF3P78545 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELF3P78545 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELF3P78545 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELF3P78545 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELF3P78545 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELF3P78545 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELF3P78545 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELF3P78545 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELF3P78545 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELF3P78545 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELF3P78545 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELF3P78545 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELF3P78545 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELF3P78545 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELF3P78545 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELF3P78545 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ELF3P78545 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELF3P78545 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELF3P78545 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELF3P78545 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELF3P78545 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELF3P78545 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ELF3P78545 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELF3P78545 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ELF3P78545 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELF3P78545 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELF3P78545 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELF3P78545 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELF3P78545 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELF3P78545 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELF3P78545 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELF3P78545 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELF3P78545 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELF3P78545 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELF3P78545 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELF3P78545 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELF3P78545 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELF3P78545 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELF3P78545 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELF3P78545 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELF3P78545 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELF3P78545 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELF3P78545 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELF3P78545 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELF3P78545 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELF3P78545 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ELF3P78545 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELF3P78545 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELF3P78545 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELF3P78545 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELF3P78545 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELF3P78545 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELF3P78545 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELF3P78545 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELF3P78545 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELF3P78545 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELF3P78545 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELF3P78545 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELF3P78545 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELF3P78545 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELF3P78545 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELF3P78545 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELF3P78545 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELF3P78545 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELF3P78545 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELF3P78545 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELF3P78545 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELF3P78545 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELF3P78545 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELF3P78545 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ELF3P78545 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ELF3P78545 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ELF3P78545 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ELF3P78545 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ELF3P78545 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELF3P78545 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELF3P78545 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELF3P78545 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELF3P78545 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELF3P78545 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELF3P78545 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELF3P78545 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELF3P78545 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELF3P78545 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ELF3P78545 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELF3P78545 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELF3P78545 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELF3P78545 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELF3P78545 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms