Protein–RNA interactions for Protein: P55072

VCP, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPP55072 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VCPP55072 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VCPP55072 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VCPP55072 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VCPP55072 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VCPP55072 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VCPP55072 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VCPP55072 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VCPP55072 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VCPP55072 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCPP55072 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCPP55072 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCPP55072 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCPP55072 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCPP55072 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCPP55072 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCPP55072 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCPP55072 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCPP55072 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCPP55072 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VCPP55072 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VCPP55072 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCPP55072 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCPP55072 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCPP55072 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCPP55072 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VCPP55072 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCPP55072 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCPP55072 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCPP55072 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCPP55072 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCPP55072 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCPP55072 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VCPP55072 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VCPP55072 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VCPP55072 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VCPP55072 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VCPP55072 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VCPP55072 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VCPP55072 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VCPP55072 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VCPP55072 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VCPP55072 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
VCPP55072 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VCPP55072 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VCPP55072 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
VCPP55072 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VCPP55072 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VCPP55072 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VCPP55072 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VCPP55072 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VCPP55072 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
VCPP55072 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VCPP55072 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VCPP55072 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VCPP55072 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VCPP55072 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VCPP55072 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VCPP55072 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VCPP55072 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCPP55072 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCPP55072 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCPP55072 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCPP55072 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCPP55072 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCPP55072 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCPP55072 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCPP55072 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VCPP55072 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VCPP55072 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCPP55072 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCPP55072 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCPP55072 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCPP55072 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCPP55072 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCPP55072 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCPP55072 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCPP55072 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VCPP55072 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCPP55072 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCPP55072 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCPP55072 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCPP55072 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VCPP55072 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCPP55072 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCPP55072 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCPP55072 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCPP55072 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCPP55072 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCPP55072 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VCPP55072 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VCPP55072 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VCPP55072 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
VCPP55072 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VCPP55072 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCPP55072 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCPP55072 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCPP55072 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VCPP55072 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
VCPP55072 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 825.7 ms