Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAD23AP54725 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
RAD23AP54725 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD23AP54725 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms