Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC24CP53992 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEC24CP53992 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24CP53992 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms