Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
AP2S1P53680 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AP2S1P53680 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms