Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF143P52747 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF143P52747 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF143P52747 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF143P52747 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF143P52747 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF143P52747 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF143P52747 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF143P52747 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF143P52747 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF143P52747 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF143P52747 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF143P52747 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF143P52747 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF143P52747 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF143P52747 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF143P52747 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF143P52747 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF143P52747 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF143P52747 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF143P52747 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF143P52747 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF143P52747 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF143P52747 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF143P52747 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF143P52747 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF143P52747 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF143P52747 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF143P52747 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF143P52747 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF143P52747 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF143P52747 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF143P52747 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF143P52747 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF143P52747 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF143P52747 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF143P52747 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF143P52747 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms