Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GTF2A2P52657 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTF2A2P52657 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2A2P52657 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms