Protein–RNA interactions for Protein: P52292

KPNA2, Importin subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA2P52292 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KPNA2P52292 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KPNA2P52292 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms