Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTDSS1P48651 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTDSS1P48651 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTDSS1P48651 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTDSS1P48651 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTDSS1P48651 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTDSS1P48651 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTDSS1P48651 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTDSS1P48651 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTDSS1P48651 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTDSS1P48651 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTDSS1P48651 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTDSS1P48651 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTDSS1P48651 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTDSS1P48651 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTDSS1P48651 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTDSS1P48651 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTDSS1P48651 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTDSS1P48651 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTDSS1P48651 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTDSS1P48651 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTDSS1P48651 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTDSS1P48651 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTDSS1P48651 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1P48651 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1P48651 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1P48651 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1P48651 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1P48651 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1P48651 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1P48651 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1P48651 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1P48651 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTDSS1P48651 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTDSS1P48651 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1P48651 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms