Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 PAN1YIR006C 4443 nt4.59□□□□□ -1.67
DDI1P40087 HST4YDR191W 1113 nt4.59□□□□□ -1.67
DDI1P40087 THI5YFL058W 1023 nt4.59□□□□□ -1.67
DDI1P40087 YGL036WYGL036W 2730 nt4.59□□□□□ -1.67
DDI1P40087 APL6YGR261C 2430 nt4.59□□□□□ -1.67
DDI1P40087 MTC2YKL098W 1074 nt4.59□□□□□ -1.67
DDI1P40087 RTT106YNL206C 1368 nt4.59□□□□□ -1.67
DDI1P40087 CSL4YNL232W 879 nt4.59□□□□□ -1.67
DDI1P40087 DAL82YNL314W 768 nt4.59□□□□□ -1.67
DDI1P40087 THI12YNL332W 1023 nt4.59□□□□□ -1.67
DDI1P40087 CAR1YPL111W 1002 nt4.59□□□□□ -1.67
DDI1P40087 MPS3YJL019W 2049 nt4.58□□□□□ -1.68
DDI1P40087 FAP1YNL023C 2898 nt4.58□□□□□ -1.68
DDI1P40087 TIF4632YGL049C 2745 nt4.58□□□□□ -1.68
DDI1P40087 YGR022CYGR022C 330 nt4.58□□□□□ -1.68
DDI1P40087 CBF1YJR060W 1056 nt4.58□□□□□ -1.68
DDI1P40087 YKL023WYKL023W 834 nt4.58□□□□□ -1.68
DDI1P40087 CLA4YNL298W 2529 nt4.58□□□□□ -1.68
DDI1P40087 FRE7YOL152W 1863 nt4.58□□□□□ -1.68
DDI1P40087 SIS2YKR072C 1689 nt4.57□□□□□ -1.68
DDI1P40087 NOB1YOR056C 1380 nt4.57□□□□□ -1.68
DDI1P40087 MRPL22YNL177C 930 nt4.57□□□□□ -1.68
DDI1P40087 YNL194CYNL194C 906 nt4.57□□□□□ -1.68
DDI1P40087 HXT7YDR342C 1713 nt4.57□□□□□ -1.68
DDI1P40087 HXT6YDR343C 1713 nt4.57□□□□□ -1.68
DDI1P40087 PHO8YDR481C 1701 nt4.57□□□□□ -1.68
DDI1P40087 GIP2YER054C 1647 nt4.57□□□□□ -1.68
DDI1P40087 RIM21YNL294C 1602 nt4.57□□□□□ -1.68
DDI1P40087 GDE1YPL110C 3672 nt4.57□□□□□ -1.68
DDI1P40087 GAL4YPL248C 2646 nt4.57□□□□□ -1.68
DDI1P40087 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt4.56□□□□□ -1.68
DDI1P40087 ARN1YHL040C 1884 nt4.56□□□□□ -1.68
DDI1P40087 RTT103YDR289C 1230 nt4.56□□□□□ -1.68
DDI1P40087 RPB4YJL140W 666 nt4.56□□□□□ -1.68
DDI1P40087 ECM1YAL059W 639 nt4.56□□□□□ -1.68
DDI1P40087 CSR1YLR380W 1227 nt4.56□□□□□ -1.68
DDI1P40087 YPL260WYPL260W 1656 nt4.56□□□□□ -1.68
DDI1P40087 SKG3YLR187W 3081 nt4.56□□□□□ -1.68
DDI1P40087 TRM44YPL030W 1704 nt4.55□□□□□ -1.68
DDI1P40087 LYS5YGL154C 819 nt4.55□□□□□ -1.68
DDI1P40087 CBP4YGR174C 513 nt4.55□□□□□ -1.68
DDI1P40087 TDH3YGR192C 999 nt4.55□□□□□ -1.68
DDI1P40087 IPI1YHR085W 1005 nt4.55□□□□□ -1.68
DDI1P40087 FMP33YJL161W 543 nt4.55□□□□□ -1.68
DDI1P40087 ARG1YOL058W 1263 nt4.55□□□□□ -1.68
DDI1P40087 RER2YBR002C 861 nt4.55□□□□□ -1.68
DDI1P40087 TRS33YOR115C 807 nt4.55□□□□□ -1.68
DDI1P40087 MAK3YPR051W 531 nt4.55□□□□□ -1.68
DDI1P40087 GRC3YLL035W 1899 nt4.55□□□□□ -1.68
DDI1P40087 PCL8YPL219W 1479 nt4.55□□□□□ -1.68
DDI1P40087 VBA2YBR293W 1425 nt4.55□□□□□ -1.68
DDI1P40087 YPL245WYPL245W 1365 nt4.54□□□□□ -1.68
DDI1P40087 EAF5YEL018W 840 nt4.54□□□□□ -1.68
DDI1P40087 LCP5YER127W 1074 nt4.54□□□□□ -1.68
DDI1P40087 CAB4YGR277C 918 nt4.54□□□□□ -1.68
DDI1P40087 YJR115WYJR115W 510 nt4.54□□□□□ -1.68
DDI1P40087 PGU1YJR153W 1086 nt4.54□□□□□ -1.68
DDI1P40087 YLR346CYLR346C 306 nt4.54□□□□□ -1.68
DDI1P40087 MAC1YMR021C 1254 nt4.54□□□□□ -1.68
DDI1P40087 KAR2YJL034W 2049 nt4.54□□□□□ -1.68
DDI1P40087 YAP1YML007W 1953 nt4.54□□□□□ -1.68
DDI1P40087 BSC5YNR069C 1470 nt4.54□□□□□ -1.68
DDI1P40087 ABF1YKL112W 2196 nt4.54□□□□□ -1.68
DDI1P40087 CTT1YGR088W 1689 nt4.54□□□□□ -1.68
DDI1P40087 MCM4YPR019W 2802 nt4.54□□□□□ -1.68
DDI1P40087 HPC2YBR215W 1878 nt4.54□□□□□ -1.68
DDI1P40087 MPH2YDL247W 1830 nt4.53□□□□□ -1.68
DDI1P40087 YDL119CYDL119C 924 nt4.53□□□□□ -1.68
DDI1P40087 SPS18YNL204C 903 nt4.53□□□□□ -1.68
DDI1P40087 SMA1YPL027W 738 nt4.53□□□□□ -1.68
DDI1P40087 ATR1YML116W 1629 nt4.53□□□□□ -1.68
DDI1P40087 APJ1YNL077W 1587 nt4.53□□□□□ -1.69
DDI1P40087 HSP82YPL240C 2130 nt4.52□□□□□ -1.69
DDI1P40087 MET3YJR010W 1536 nt4.52□□□□□ -1.69
DDI1P40087 YGR122WYGR122W 1209 nt4.52□□□□□ -1.69
DDI1P40087 YHR127WYHR127W 732 nt4.52□□□□□ -1.69
DDI1P40087 VID22YLR373C 2706 nt4.52□□□□□ -1.69
DDI1P40087 BOP2YLR267W 1713 nt4.52□□□□□ -1.69
DDI1P40087 MBP1YDL056W 2502 nt4.51□□□□□ -1.69
DDI1P40087 SDA1YGR245C 2304 nt4.51□□□□□ -1.69
DDI1P40087 MRE11YMR224C 2079 nt4.51□□□□□ -1.69
DDI1P40087 DON1YDR273W 1098 nt4.51□□□□□ -1.69
DDI1P40087 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt4.51□□□□□ -1.69
DDI1P40087 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt4.51□□□□□ -1.69
DDI1P40087 YJL068CYJL068C 900 nt4.51□□□□□ -1.69
DDI1P40087 MRP17YKL003C 396 nt4.51□□□□□ -1.69
DDI1P40087 RFA2YNL312W 822 nt4.51□□□□□ -1.69
DDI1P40087 CBP3YPL215W 1008 nt4.51□□□□□ -1.69
DDI1P40087 FRS1YLR060W 1788 nt4.5□□□□□ -1.69
DDI1P40087 SUR2YDR297W 1050 nt4.5□□□□□ -1.69
DDI1P40087 AI5_BETAQ0075 1065 nt4.5□□□□□ -1.69
DDI1P40087 GLE2YER107C 1098 nt4.5□□□□□ -1.69
DDI1P40087 SEH1YGL100W 1050 nt4.5□□□□□ -1.69
DDI1P40087 GPP1YIL053W 753 nt4.5□□□□□ -1.69
DDI1P40087 YMR102CYMR102C 2505 nt4.5□□□□□ -1.69
DDI1P40087 UBP7YIL156W 3216 nt4.5□□□□□ -1.69
DDI1P40087 FDC1YDR539W 1512 nt4.5□□□□□ -1.69
DDI1P40087 DCN1YLR128W 810 nt4.49□□□□□ -1.69
DDI1P40087 GSP2YOR185C 663 nt4.49□□□□□ -1.69
DDI1P40087 NHP6AYPR052C 282 nt4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 53.7 ms