Protein–RNA interactions for Protein: P34228

SEF1, Putative transcription factor SEF1, yeastyeast

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEF1P34228 YNL296WYNL296W 315 nt4.99□□□□□ -1.61
SEF1P34228 FES1YBR101C 873 nt4.99□□□□□ -1.61
SEF1P34228 TRK2YKR050W 2670 nt4.99□□□□□ -1.61
SEF1P34228 AFT1YGL071W 2073 nt4.98□□□□□ -1.61
SEF1P34228 UBP9YER098W 2265 nt4.98□□□□□ -1.61
SEF1P34228 MED2YDL005C 1296 nt4.98□□□□□ -1.61
SEF1P34228 IDP1YDL066W 1287 nt4.98□□□□□ -1.61
SEF1P34228 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt4.98□□□□□ -1.61
SEF1P34228 MOB2YFL034C-B 864 nt4.98□□□□□ -1.61
SEF1P34228 YGR122WYGR122W 1209 nt4.98□□□□□ -1.61
SEF1P34228 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt4.98□□□□□ -1.61
SEF1P34228 COT1YOR316C 1320 nt4.97□□□□□ -1.61
SEF1P34228 PAF1YBR279W 1338 nt4.97□□□□□ -1.61
SEF1P34228 UGA1YGR019W 1416 nt4.97□□□□□ -1.61
SEF1P34228 MTC1YJL123C 1437 nt4.97□□□□□ -1.61
SEF1P34228 NGL2YMR285C 1548 nt4.97□□□□□ -1.61
SEF1P34228 SHE10YGL228W 1734 nt4.97□□□□□ -1.61
SEF1P34228 UTR4YEL038W 684 nt4.97□□□□□ -1.61
SEF1P34228 GRX4YER174C 735 nt4.97□□□□□ -1.61
SEF1P34228 YLL059CYLL059C 507 nt4.97□□□□□ -1.61
SEF1P34228 PGA3YML125C 939 nt4.97□□□□□ -1.61
SEF1P34228 ROT1YMR200W 771 nt4.97□□□□□ -1.61
SEF1P34228 RBD2YPL246C 789 nt4.97□□□□□ -1.61
SEF1P34228 BBP1YPL255W 1158 nt4.97□□□□□ -1.61
SEF1P34228 UBA2YDR390C 1911 nt4.97□□□□□ -1.61
SEF1P34228 DPH2YKL191W 1605 nt4.97□□□□□ -1.61
SEF1P34228 ELP2YGR200C 2367 nt4.97□□□□□ -1.61
SEF1P34228 TIP20YGL145W 2106 nt4.96□□□□□ -1.62
SEF1P34228 YHR177WYHR177W 1362 nt4.96□□□□□ -1.62
SEF1P34228 CKS1YBR135W 453 nt4.96□□□□□ -1.62
SEF1P34228 HXT7YDR342C 1713 nt4.96□□□□□ -1.62
SEF1P34228 HXT6YDR343C 1713 nt4.96□□□□□ -1.62
SEF1P34228 DEG1YFL001W 1329 nt4.96□□□□□ -1.62
SEF1P34228 LUC7YDL087C 786 nt4.95□□□□□ -1.62
SEF1P34228 YGL185CYGL185C 1140 nt4.95□□□□□ -1.62
SEF1P34228 PRS1YKL181W 1284 nt4.95□□□□□ -1.62
SEF1P34228 PRM9YAR031W 897 nt4.95□□□□□ -1.62
SEF1P34228 RPS31YLR167W 459 nt4.95□□□□□ -1.62
SEF1P34228 YOL050CYOL050C 321 nt4.95□□□□□ -1.62
SEF1P34228 ATE1YGL017W 1512 nt4.95□□□□□ -1.62
SEF1P34228 TFG1YGR186W 2208 nt4.95□□□□□ -1.62
SEF1P34228 RFA1YAR007C 1866 nt4.94□□□□□ -1.62
SEF1P34228 APL6YGR261C 2430 nt4.94□□□□□ -1.62
SEF1P34228 IMA1YGR287C 1770 nt4.94□□□□□ -1.62
SEF1P34228 ASH1YKL185W 1767 nt4.94□□□□□ -1.62
SEF1P34228 MCM21YDR318W 1107 nt4.94□□□□□ -1.62
SEF1P34228 SEM1YDR363W-A 270 nt4.94□□□□□ -1.62
SEF1P34228 YIL086CYIL086C 309 nt4.94□□□□□ -1.62
SEF1P34228 YLR317WYLR317W 435 nt4.94□□□□□ -1.62
SEF1P34228 YLR346CYLR346C 306 nt4.94□□□□□ -1.62
SEF1P34228 SNO1YMR095C 675 nt4.94□□□□□ -1.62
SEF1P34228 RPS15YOL040C 429 nt4.94□□□□□ -1.62
SEF1P34228 COX11YPL132W 903 nt4.94□□□□□ -1.62
SEF1P34228 ASF2YDL197C 1578 nt4.94□□□□□ -1.62
SEF1P34228 SNF3YDL194W 2655 nt4.94□□□□□ -1.62
SEF1P34228 FRE3YOR381W 2136 nt4.93□□□□□ -1.62
SEF1P34228 UBC1YDR177W 648 nt4.93□□□□□ -1.62
SEF1P34228 ERG26YGL001C 1050 nt4.93□□□□□ -1.62
SEF1P34228 DSD1YGL196W 1287 nt4.93□□□□□ -1.62
SEF1P34228 YGR273CYGR273C 525 nt4.93□□□□□ -1.62
SEF1P34228 RPS0BYLR048W 759 nt4.93□□□□□ -1.62
SEF1P34228 SAP155YFR040W 3009 nt4.93□□□□□ -1.62
SEF1P34228 CAF16YFL028C 870 nt4.92□□□□□ -1.62
SEF1P34228 YHR127WYHR127W 732 nt4.92□□□□□ -1.62
SEF1P34228 YJR085CYJR085C 318 nt4.92□□□□□ -1.62
SEF1P34228 XPT1YJR133W 630 nt4.92□□□□□ -1.62
SEF1P34228 ECM15YBL001C 315 nt4.92□□□□□ -1.62
SEF1P34228 PPG1YNR032W 1107 nt4.92□□□□□ -1.62
SEF1P34228 ETR1YBR026C 1143 nt4.92□□□□□ -1.62
SEF1P34228 RAD17YOR368W 1206 nt4.92□□□□□ -1.62
SEF1P34228 CBC2YPL178W 627 nt4.92□□□□□ -1.62
SEF1P34228 UTP7YER082C 1665 nt4.92□□□□□ -1.62
SEF1P34228 GYP1YOR070C 1914 nt4.91□□□□□ -1.62
SEF1P34228 TEF1YPR080W 1377 nt4.91□□□□□ -1.62
SEF1P34228 TEF2YBR118W 1377 nt4.91□□□□□ -1.62
SEF1P34228 WTM2YOR229W 1404 nt4.91□□□□□ -1.62
SEF1P34228 EKI1YDR147W 1605 nt4.91□□□□□ -1.62
SEF1P34228 RMD1YDL001W 1293 nt4.91□□□□□ -1.62
SEF1P34228 TIM21YGR033C 720 nt4.91□□□□□ -1.62
SEF1P34228 REX3YLR107W 1215 nt4.91□□□□□ -1.62
SEF1P34228 YNL234WYNL234W 1281 nt4.91□□□□□ -1.62
SEF1P34228 ANT1YPR128C 987 nt4.91□□□□□ -1.62
SEF1P34228 SIA1YOR137C 1869 nt4.91□□□□□ -1.62
SEF1P34228 HXT4YHR092C 1731 nt4.91□□□□□ -1.62
SEF1P34228 SUM1YDR310C 3189 nt4.91□□□□□ -1.62
SEF1P34228 RAD57YDR004W 1383 nt4.91□□□□□ -1.62
SEF1P34228 BAP2YBR068C 1830 nt4.9□□□□□ -1.62
SEF1P34228 PHO8YDR481C 1701 nt4.9□□□□□ -1.62
SEF1P34228 GAT3YLR013W 426 nt4.9□□□□□ -1.63
SEF1P34228 YLR036CYLR036C 612 nt4.9□□□□□ -1.63
SEF1P34228 YPR015CYPR015C 744 nt4.9□□□□□ -1.63
SEF1P34228 UBC4YBR082C 447 nt4.9□□□□□ -1.63
SEF1P34228 ACF2YLR144C 2340 nt4.9□□□□□ -1.63
SEF1P34228 GEP3YOR205C 1671 nt4.89□□□□□ -1.63
SEF1P34228 THI22YPR121W 1719 nt4.89□□□□□ -1.63
SEF1P34228 MRPL7YDR237W 879 nt4.89□□□□□ -1.63
SEF1P34228 TDH3YGR192C 999 nt4.89□□□□□ -1.63
SEF1P34228 YLF2YHL014C 1218 nt4.89□□□□□ -1.63
SEF1P34228 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt4.89□□□□□ -1.63
SEF1P34228 PFA3YNL326C 1011 nt4.89□□□□□ -1.63
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