Protein–RNA interactions for Protein: P31645

SLC6A4, Sodium-dependent serotonin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A4P31645 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC6A4P31645 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC6A4P31645 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms