Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR2CP19387 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2CP19387 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR2CP19387 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms