Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NELFEP18615 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NELFEP18615 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NELFEP18615 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NELFEP18615 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NELFEP18615 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NELFEP18615 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NELFEP18615 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NELFEP18615 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NELFEP18615 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NELFEP18615 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NELFEP18615 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NELFEP18615 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NELFEP18615 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NELFEP18615 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NELFEP18615 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NELFEP18615 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NELFEP18615 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NELFEP18615 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NELFEP18615 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NELFEP18615 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NELFEP18615 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NELFEP18615 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NELFEP18615 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NELFEP18615 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NELFEP18615 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NELFEP18615 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NELFEP18615 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NELFEP18615 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NELFEP18615 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NELFEP18615 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NELFEP18615 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NELFEP18615 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NELFEP18615 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NELFEP18615 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NELFEP18615 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NELFEP18615 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NELFEP18615 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NELFEP18615 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NELFEP18615 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NELFEP18615 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NELFEP18615 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NELFEP18615 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NELFEP18615 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NELFEP18615 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NELFEP18615 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NELFEP18615 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NELFEP18615 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NELFEP18615 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NELFEP18615 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NELFEP18615 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NELFEP18615 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NELFEP18615 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NELFEP18615 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NELFEP18615 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NELFEP18615 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NELFEP18615 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NELFEP18615 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NELFEP18615 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NELFEP18615 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NELFEP18615 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NELFEP18615 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NELFEP18615 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NELFEP18615 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NELFEP18615 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NELFEP18615 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NELFEP18615 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NELFEP18615 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NELFEP18615 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NELFEP18615 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NELFEP18615 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NELFEP18615 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NELFEP18615 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NELFEP18615 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NELFEP18615 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NELFEP18615 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NELFEP18615 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NELFEP18615 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NELFEP18615 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NELFEP18615 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NELFEP18615 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NELFEP18615 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NELFEP18615 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NELFEP18615 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NELFEP18615 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NELFEP18615 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NELFEP18615 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NELFEP18615 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NELFEP18615 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NELFEP18615 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NELFEP18615 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NELFEP18615 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NELFEP18615 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NELFEP18615 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NELFEP18615 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NELFEP18615 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NELFEP18615 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NELFEP18615 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NELFEP18615 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NELFEP18615 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms