Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RLBP1P12271 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RLBP1P12271 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RLBP1P12271 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms