Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DMDP11532 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DMDP11532 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DMDP11532 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DMDP11532 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DMDP11532 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DMDP11532 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DMDP11532 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DMDP11532 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DMDP11532 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DMDP11532 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DMDP11532 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DMDP11532 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DMDP11532 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DMDP11532 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
DMDP11532 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
DMDP11532 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.27
DMDP11532 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
DMDP11532 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DMDP11532 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DMDP11532 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DMDP11532 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DMDP11532 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DMDP11532 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DMDP11532 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DMDP11532 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DMDP11532 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DMDP11532 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DMDP11532 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DMDP11532 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DMDP11532 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DMDP11532 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DMDP11532 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DMDP11532 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DMDP11532 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DMDP11532 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DMDP11532 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DMDP11532 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DMDP11532 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DMDP11532 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DMDP11532 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DMDP11532 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DMDP11532 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DMDP11532 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DMDP11532 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DMDP11532 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DMDP11532 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DMDP11532 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DMDP11532 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DMDP11532 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DMDP11532 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DMDP11532 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DMDP11532 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DMDP11532 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DMDP11532 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DMDP11532 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DMDP11532 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DMDP11532 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DMDP11532 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DMDP11532 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DMDP11532 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DMDP11532 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DMDP11532 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DMDP11532 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DMDP11532 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DMDP11532 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DMDP11532 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DMDP11532 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DMDP11532 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DMDP11532 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DMDP11532 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DMDP11532 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DMDP11532 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DMDP11532 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DMDP11532 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DMDP11532 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DMDP11532 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DMDP11532 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DMDP11532 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DMDP11532 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DMDP11532 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DMDP11532 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DMDP11532 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DMDP11532 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DMDP11532 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DMDP11532 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DMDP11532 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DMDP11532 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DMDP11532 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DMDP11532 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DMDP11532 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DMDP11532 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DMDP11532 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DMDP11532 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DMDP11532 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DMDP11532 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DMDP11532 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DMDP11532 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DMDP11532 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DMDP11532 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms