Protein–RNA interactions for Protein: P10828

THRB, Thyroid hormone receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRBP10828 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THRBP10828 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THRBP10828 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THRBP10828 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THRBP10828 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THRBP10828 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THRBP10828 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THRBP10828 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THRBP10828 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THRBP10828 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THRBP10828 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THRBP10828 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THRBP10828 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THRBP10828 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THRBP10828 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THRBP10828 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THRBP10828 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THRBP10828 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THRBP10828 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THRBP10828 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THRBP10828 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THRBP10828 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THRBP10828 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THRBP10828 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THRBP10828 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THRBP10828 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
THRBP10828 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
THRBP10828 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRBP10828 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRBP10828 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRBP10828 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRBP10828 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRBP10828 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRBP10828 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRBP10828 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
THRBP10828 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
THRBP10828 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
THRBP10828 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRBP10828 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRBP10828 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRBP10828 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRBP10828 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRBP10828 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRBP10828 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRBP10828 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
THRBP10828 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THRBP10828 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THRBP10828 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THRBP10828 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THRBP10828 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THRBP10828 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THRBP10828 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THRBP10828 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THRBP10828 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THRBP10828 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THRBP10828 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THRBP10828 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THRBP10828 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THRBP10828 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
THRBP10828 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
THRBP10828 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
THRBP10828 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THRBP10828 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THRBP10828 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THRBP10828 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
THRBP10828 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
THRBP10828 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
THRBP10828 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
THRBP10828 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
THRBP10828 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
THRBP10828 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
THRBP10828 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
THRBP10828 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
THRBP10828 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
THRBP10828 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THRBP10828 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
THRBP10828 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
THRBP10828 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THRBP10828 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THRBP10828 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THRBP10828 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THRBP10828 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
THRBP10828 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THRBP10828 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
THRBP10828 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THRBP10828 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THRBP10828 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
THRBP10828 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
THRBP10828 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THRBP10828 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THRBP10828 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THRBP10828 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THRBP10828 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
THRBP10828 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.31■■□□□ 1
THRBP10828 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
THRBP10828 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
THRBP10828 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THRBP10828 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.3■■□□□ 1
THRBP10828 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
THRBP10828 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms