Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI4P10075 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI4P10075 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI4P10075 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI4P10075 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI4P10075 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI4P10075 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI4P10075 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI4P10075 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI4P10075 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI4P10075 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI4P10075 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI4P10075 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI4P10075 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI4P10075 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI4P10075 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI4P10075 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI4P10075 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI4P10075 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI4P10075 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI4P10075 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI4P10075 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI4P10075 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI4P10075 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI4P10075 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI4P10075 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI4P10075 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI4P10075 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI4P10075 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI4P10075 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI4P10075 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI4P10075 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI4P10075 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI4P10075 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI4P10075 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI4P10075 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI4P10075 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI4P10075 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI4P10075 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI4P10075 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI4P10075 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI4P10075 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI4P10075 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLI4P10075 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLI4P10075 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLI4P10075 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLI4P10075 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLI4P10075 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLI4P10075 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLI4P10075 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLI4P10075 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLI4P10075 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLI4P10075 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLI4P10075 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLI4P10075 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GLI4P10075 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI4P10075 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI4P10075 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI4P10075 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI4P10075 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI4P10075 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI4P10075 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI4P10075 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI4P10075 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI4P10075 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI4P10075 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI4P10075 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI4P10075 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GLI4P10075 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI4P10075 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI4P10075 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI4P10075 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI4P10075 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI4P10075 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI4P10075 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI4P10075 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI4P10075 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI4P10075 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI4P10075 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI4P10075 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI4P10075 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI4P10075 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI4P10075 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GLI4P10075 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GLI4P10075 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GLI4P10075 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GLI4P10075 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GLI4P10075 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GLI4P10075 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GLI4P10075 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GLI4P10075 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GLI4P10075 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GLI4P10075 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GLI4P10075 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GLI4P10075 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GLI4P10075 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GLI4P10075 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GLI4P10075 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GLI4P10075 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GLI4P10075 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms