Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITGB3P05106 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ITGB3P05106 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITGB3P05106 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms