Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIX3O95343 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIX3O95343 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIX3O95343 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIX3O95343 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIX3O95343 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIX3O95343 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIX3O95343 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIX3O95343 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIX3O95343 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX3O95343 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX3O95343 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX3O95343 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX3O95343 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX3O95343 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX3O95343 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX3O95343 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIX3O95343 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIX3O95343 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIX3O95343 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIX3O95343 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIX3O95343 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SIX3O95343 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIX3O95343 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIX3O95343 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SIX3O95343 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIX3O95343 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIX3O95343 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SIX3O95343 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SIX3O95343 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SIX3O95343 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIX3O95343 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIX3O95343 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIX3O95343 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIX3O95343 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIX3O95343 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIX3O95343 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIX3O95343 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIX3O95343 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIX3O95343 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIX3O95343 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIX3O95343 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIX3O95343 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX3O95343 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX3O95343 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX3O95343 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX3O95343 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX3O95343 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX3O95343 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX3O95343 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX3O95343 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX3O95343 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX3O95343 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX3O95343 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIX3O95343 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIX3O95343 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIX3O95343 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIX3O95343 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIX3O95343 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIX3O95343 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SIX3O95343 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIX3O95343 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIX3O95343 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIX3O95343 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIX3O95343 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIX3O95343 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIX3O95343 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIX3O95343 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX3O95343 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX3O95343 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX3O95343 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX3O95343 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX3O95343 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX3O95343 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX3O95343 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX3O95343 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX3O95343 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX3O95343 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX3O95343 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX3O95343 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX3O95343 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX3O95343 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX3O95343 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX3O95343 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX3O95343 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX3O95343 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX3O95343 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX3O95343 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX3O95343 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX3O95343 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX3O95343 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX3O95343 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX3O95343 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX3O95343 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX3O95343 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX3O95343 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX3O95343 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX3O95343 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX3O95343 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX3O95343 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms