Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
MBD4O95243 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MBD4O95243 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MBD4O95243 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
MBD4O95243 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MBD4O95243 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MBD4O95243 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MBD4O95243 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MBD4O95243 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MBD4O95243 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MBD4O95243 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MBD4O95243 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MBD4O95243 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MBD4O95243 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MBD4O95243 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MBD4O95243 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MBD4O95243 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MBD4O95243 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MBD4O95243 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MBD4O95243 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MBD4O95243 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MBD4O95243 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MBD4O95243 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MBD4O95243 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
MBD4O95243 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MBD4O95243 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
MBD4O95243 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MBD4O95243 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MBD4O95243 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MBD4O95243 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MBD4O95243 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MBD4O95243 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MBD4O95243 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MBD4O95243 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MBD4O95243 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MBD4O95243 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MBD4O95243 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MBD4O95243 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MBD4O95243 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MBD4O95243 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MBD4O95243 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MBD4O95243 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MBD4O95243 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MBD4O95243 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MBD4O95243 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MBD4O95243 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MBD4O95243 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MBD4O95243 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MBD4O95243 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MBD4O95243 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MBD4O95243 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MBD4O95243 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MBD4O95243 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MBD4O95243 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MBD4O95243 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MBD4O95243 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MBD4O95243 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MBD4O95243 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MBD4O95243 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MBD4O95243 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MBD4O95243 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MBD4O95243 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MBD4O95243 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MBD4O95243 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MBD4O95243 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MBD4O95243 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MBD4O95243 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MBD4O95243 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MBD4O95243 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MBD4O95243 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MBD4O95243 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MBD4O95243 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MBD4O95243 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MBD4O95243 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MBD4O95243 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MBD4O95243 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MBD4O95243 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MBD4O95243 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MBD4O95243 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MBD4O95243 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MBD4O95243 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MBD4O95243 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MBD4O95243 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MBD4O95243 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MBD4O95243 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MBD4O95243 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MBD4O95243 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MBD4O95243 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MBD4O95243 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MBD4O95243 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MBD4O95243 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MBD4O95243 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MBD4O95243 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MBD4O95243 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MBD4O95243 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MBD4O95243 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MBD4O95243 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MBD4O95243 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MBD4O95243 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MBD4O95243 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms