Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLGNO14967 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLGNO14967 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLGNO14967 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLGNO14967 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLGNO14967 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLGNO14967 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLGNO14967 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLGNO14967 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLGNO14967 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLGNO14967 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLGNO14967 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLGNO14967 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLGNO14967 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLGNO14967 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLGNO14967 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLGNO14967 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLGNO14967 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLGNO14967 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLGNO14967 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLGNO14967 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLGNO14967 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLGNO14967 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLGNO14967 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLGNO14967 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLGNO14967 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLGNO14967 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLGNO14967 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLGNO14967 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLGNO14967 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLGNO14967 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLGNO14967 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLGNO14967 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLGNO14967 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLGNO14967 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLGNO14967 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLGNO14967 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLGNO14967 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLGNO14967 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLGNO14967 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLGNO14967 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLGNO14967 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLGNO14967 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLGNO14967 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLGNO14967 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLGNO14967 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLGNO14967 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLGNO14967 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLGNO14967 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLGNO14967 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLGNO14967 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLGNO14967 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLGNO14967 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLGNO14967 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLGNO14967 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLGNO14967 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLGNO14967 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLGNO14967 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLGNO14967 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLGNO14967 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLGNO14967 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLGNO14967 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLGNO14967 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLGNO14967 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLGNO14967 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLGNO14967 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLGNO14967 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLGNO14967 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLGNO14967 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLGNO14967 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLGNO14967 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLGNO14967 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLGNO14967 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLGNO14967 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLGNO14967 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLGNO14967 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLGNO14967 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLGNO14967 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLGNO14967 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLGNO14967 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLGNO14967 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLGNO14967 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLGNO14967 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLGNO14967 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLGNO14967 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLGNO14967 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLGNO14967 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLGNO14967 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLGNO14967 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLGNO14967 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLGNO14967 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLGNO14967 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLGNO14967 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLGNO14967 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLGNO14967 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLGNO14967 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLGNO14967 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLGNO14967 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLGNO14967 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLGNO14967 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms