Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MCRIP1C9JLW8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MCRIP1C9JLW8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms