Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ODF3BA8MYP8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ODF3BA8MYP8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms