Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C4orf47A7E2U8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C4orf47A7E2U8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C4orf47A7E2U8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms