Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PRAMEF25A6NGN4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRAMEF25A6NGN4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF25A6NGN4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms