Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KRT87PA6NCN2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT87PA6NCN2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT87PA6NCN2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms