Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0B3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0B3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A087X0B3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
A0A087X0B3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A087X0B3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms