Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RHBDD3Q9Y3P4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RHBDD3Q9Y3P4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.5 ms