Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2B5

VPS9D1, VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1Q9Y2B5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VPS9D1Q9Y2B5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VPS9D1Q9Y2B5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VPS9D1Q9Y2B5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms