Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDP2Q9P2J9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDP2Q9P2J9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDP2Q9P2J9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms