Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ1

COA4, Cytochrome c oxidase assembly factor 4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA4Q9NYJ1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COA4Q9NYJ1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COA4Q9NYJ1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COA4Q9NYJ1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COA4Q9NYJ1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COA4Q9NYJ1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COA4Q9NYJ1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COA4Q9NYJ1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COA4Q9NYJ1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COA4Q9NYJ1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COA4Q9NYJ1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COA4Q9NYJ1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COA4Q9NYJ1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COA4Q9NYJ1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COA4Q9NYJ1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COA4Q9NYJ1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COA4Q9NYJ1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COA4Q9NYJ1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COA4Q9NYJ1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COA4Q9NYJ1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COA4Q9NYJ1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
COA4Q9NYJ1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COA4Q9NYJ1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
COA4Q9NYJ1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COA4Q9NYJ1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
COA4Q9NYJ1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
COA4Q9NYJ1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
COA4Q9NYJ1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms