Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA2D2Q9NY47 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D2Q9NY47 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CACNA2D2Q9NY47 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms