Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DNAJC17Q9NVM6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJC17Q9NVM6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms