Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCK1

ZDBF2, DBF4-type zinc finger-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDBF2Q9HCK1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZDBF2Q9HCK1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZDBF2Q9HCK1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZDBF2Q9HCK1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZDBF2Q9HCK1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZDBF2Q9HCK1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZDBF2Q9HCK1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZDBF2Q9HCK1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZDBF2Q9HCK1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZDBF2Q9HCK1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZDBF2Q9HCK1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZDBF2Q9HCK1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZDBF2Q9HCK1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZDBF2Q9HCK1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZDBF2Q9HCK1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZDBF2Q9HCK1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZDBF2Q9HCK1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZDBF2Q9HCK1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZDBF2Q9HCK1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZDBF2Q9HCK1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZDBF2Q9HCK1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZDBF2Q9HCK1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZDBF2Q9HCK1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZDBF2Q9HCK1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZDBF2Q9HCK1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZDBF2Q9HCK1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZDBF2Q9HCK1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZDBF2Q9HCK1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZDBF2Q9HCK1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZDBF2Q9HCK1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZDBF2Q9HCK1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZDBF2Q9HCK1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZDBF2Q9HCK1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZDBF2Q9HCK1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZDBF2Q9HCK1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZDBF2Q9HCK1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZDBF2Q9HCK1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZDBF2Q9HCK1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZDBF2Q9HCK1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ZDBF2Q9HCK1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZDBF2Q9HCK1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZDBF2Q9HCK1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZDBF2Q9HCK1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZDBF2Q9HCK1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZDBF2Q9HCK1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZDBF2Q9HCK1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZDBF2Q9HCK1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZDBF2Q9HCK1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZDBF2Q9HCK1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZDBF2Q9HCK1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZDBF2Q9HCK1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZDBF2Q9HCK1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZDBF2Q9HCK1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZDBF2Q9HCK1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms