Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM39BQ9GZU3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM39BQ9GZU3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM39BQ9GZU3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM39BQ9GZU3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM39BQ9GZU3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM39BQ9GZU3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM39BQ9GZU3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM39BQ9GZU3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM39BQ9GZU3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM39BQ9GZU3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM39BQ9GZU3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM39BQ9GZU3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM39BQ9GZU3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM39BQ9GZU3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM39BQ9GZU3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM39BQ9GZU3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM39BQ9GZU3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM39BQ9GZU3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM39BQ9GZU3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM39BQ9GZU3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM39BQ9GZU3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM39BQ9GZU3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM39BQ9GZU3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM39BQ9GZU3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM39BQ9GZU3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM39BQ9GZU3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM39BQ9GZU3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM39BQ9GZU3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM39BQ9GZU3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM39BQ9GZU3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM39BQ9GZU3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM39BQ9GZU3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM39BQ9GZU3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM39BQ9GZU3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM39BQ9GZU3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM39BQ9GZU3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TMEM39BQ9GZU3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TMEM39BQ9GZU3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TMEM39BQ9GZU3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125 ms