Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVK-6Q9BXR3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVK-6Q9BXR3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVK-6Q9BXR3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVK-6Q9BXR3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVK-6Q9BXR3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVK-6Q9BXR3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVK-6Q9BXR3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVK-6Q9BXR3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVK-6Q9BXR3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVK-6Q9BXR3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVK-6Q9BXR3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVK-6Q9BXR3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVK-6Q9BXR3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVK-6Q9BXR3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVK-6Q9BXR3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVK-6Q9BXR3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ERVK-6Q9BXR3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ERVK-6Q9BXR3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ERVK-6Q9BXR3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVK-6Q9BXR3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVK-6Q9BXR3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVK-6Q9BXR3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVK-6Q9BXR3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVK-6Q9BXR3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVK-6Q9BXR3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ERVK-6Q9BXR3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-6Q9BXR3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-6Q9BXR3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-6Q9BXR3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-6Q9BXR3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-6Q9BXR3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-6Q9BXR3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-6Q9BXR3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-6Q9BXR3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-6Q9BXR3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-6Q9BXR3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERVK-6Q9BXR3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-6Q9BXR3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-6Q9BXR3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-6Q9BXR3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-6Q9BXR3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-6Q9BXR3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-6Q9BXR3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-6Q9BXR3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-6Q9BXR3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ERVK-6Q9BXR3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms