Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVK6

TMED9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED9Q9BVK6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMED9Q9BVK6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMED9Q9BVK6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMED9Q9BVK6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms