Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EFHD1Q9BUP0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFHD1Q9BUP0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.9 ms