Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG2

SH2D3A, SH2 domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3AQ9BRG2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SH2D3AQ9BRG2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SH2D3AQ9BRG2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH2D3AQ9BRG2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms