Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMAD5Q99717 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMAD5Q99717 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms