Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CNBD2Q96M20 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CNBD2Q96M20 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNBD2Q96M20 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms