Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC35A4Q96G79 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC35A4Q96G79 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.5 ms