Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPTQ96BT3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPTQ96BT3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms