Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC47Q96A33 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC47Q96A33 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC47Q96A33 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
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