Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SELENOMQ8WWX9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SELENOMQ8WWX9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SELENOMQ8WWX9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms